學(xué)校創(chuàng)建于1978年。2010年6月，長郡中學(xué)與芙蓉區(qū)政府深度合作，學(xué)校更名為長郡芙蓉中學(xué)，遷址到馬王堆中路88號。

這是湖南省第一批由區(qū)政府與名校合作辦學(xué)的學(xué)校，體現(xiàn)了芙蓉區(qū)委、區(qū)政府對辦好芙蓉教育的高瞻遠矚和務(wù)實篤行，也拉開了芙蓉區(qū)跟四大名校集團合作的序幕。

轉(zhuǎn)眼十三年。校園四季，歲月三秋，美好生長。

芙蓉國里盡朝暉，中國工程院院士袁隆平為學(xué)校題詞，中國科學(xué)院院士印遇龍在學(xué)校設(shè)立創(chuàng)新人才院士輔導(dǎo)站，傾心關(guān)注人才培養(yǎng)。這不僅是學(xué)校榮光，更是每一位長郡芙蓉教育人努力的方向。

作為首批長郡中學(xué)托管的學(xué)校，作為長郡集團指標生完成情況最優(yōu)秀校之一，長郡芙蓉中學(xué)是全省首個設(shè)立創(chuàng)新人才院士輔導(dǎo)站的學(xué)校，是湖南省唯一全國首批知識產(chǎn)權(quán)教育試點校，是全市唯一科技創(chuàng)新名師工作室落戶學(xué)校，是長沙市文明標兵校園、長沙市書香校園……這是一所長郡教育集團里教育資源高度共享、教育質(zhì)量領(lǐng)先且辦學(xué)特色明顯的學(xué)校。

直博中國科學(xué)院大學(xué)大氣遙感專業(yè)的賀文卓是長郡芙蓉中學(xué)15屆畢業(yè)生，高中就讀于長郡中學(xué)，曾獲“長沙市優(yōu)秀青少年科技創(chuàng)新人才”稱號。他在回憶初中母校時，感激地說：“三年成長，離不開母校培養(yǎng)，感恩成長路上的每一個引路人。得不到他們的諄諄教誨，何來今天的我？”

少年應(yīng)有鴻鵠志,當騎駿馬踏平川。校長夏琴表示，未來學(xué)校將緊貼民族復(fù)興對高素質(zhì)拔尖創(chuàng)新人才的大力需求，培育有創(chuàng)新基因的中國少年。
學(xué)校為芙蓉區(qū)科技創(chuàng)新校際聯(lián)盟的盟主校，還先后獲得全國中小學(xué)知識產(chǎn)權(quán)教育示范學(xué)校（湖南省唯一）、湖南省十佳科技創(chuàng)新學(xué)校、第三屆湖南省芙蓉創(chuàng)新獎、長沙市科技教育特色學(xué)校、全國知識產(chǎn)權(quán)教育與科技創(chuàng)新特色學(xué)校、全國創(chuàng)造教育先進集體、全國地理科普教育基地、湖南省芙蓉創(chuàng)新獎學(xué)�；蚪逃龣C構(gòu)獎、湖南省中小學(xué)創(chuàng)造教育基地、長沙市創(chuàng)新教育先進單位、長沙市第32屆青少年科技創(chuàng)新大賽優(yōu)秀組織單位獎等集體榮譽稱號25個。